Detalhe da pesquisa
1.
A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance.
Cell;
184(13): 3376-3393.e17, 2021 06 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34043940
2.
Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery.
Nature;
602(7895): 142-147, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35082445
3.
Cue: a deep-learning framework for structural variant discovery and genotyping.
Nat Methods;
20(4): 559-568, 2023 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-36959322
4.
Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges.
Nat Methods;
19(4): 429-440, 2022 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35396482
5.
cloudrnaSPAdes: isoform assembly using bulk barcoded RNA sequencing data.
Bioinformatics;
40(2)2024 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-38262343
6.
Efficient detection and assembly of non-reference DNA sequences with synthetic long reads.
Nucleic Acids Res;
50(18): e108, 2022 10 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-35924489
7.
Minerva: an alignment- and reference-free approach to deconvolve Linked-Reads for metagenomics.
Genome Res;
29(1): 116-124, 2019 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-30523036
8.
BiosyntheticSPAdes: reconstructing biosynthetic gene clusters from assembly graphs.
Genome Res;
29(8): 1352-1362, 2019 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-31160374
9.
coronaSPAdes: from biosynthetic gene clusters to RNA viral assemblies.
Bioinformatics;
38(1): 1-8, 2021 12 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-34406356
10.
A Deep Learning Approach to Diagnostic Classification of Prostate Cancer Using Pathology-Radiology Fusion.
J Magn Reson Imaging;
54(2): 462-471, 2021 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33719168
11.
metaSPAdes: a new versatile metagenomic assembler.
Genome Res;
27(5): 824-834, 2017 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-28298430
12.
Benchmarking State-of-the-Art Approaches for Norovirus Genome Assembly in Metagenome Sample.
Biology (Basel);
12(8)2023 Jul 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37626951
13.
cloudrnaSPAdes: Isoform assembly using bulk barcoded RNA sequencing data.
bioRxiv;
2023 Jul 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37546844
14.
Ariadne: synthetic long read deconvolution using assembly graphs.
Genome Biol;
24(1): 197, 2023 08 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-37641111
15.
A comprehensive metagenomics framework to characterize organisms relevant for planetary protection.
Microbiome;
9(1): 82, 2021 04 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33795001
16.
Shotgun transcriptome, spatial omics, and isothermal profiling of SARS-CoV-2 infection reveals unique host responses, viral diversification, and drug interactions.
Nat Commun;
12(1): 1660, 2021 03 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-33712587
17.
Using SPAdes De Novo Assembler.
Curr Protoc Bioinformatics;
70(1): e102, 2020 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32559359
18.
Shotgun Transcriptome and Isothermal Profiling of SARS-CoV-2 Infection Reveals Unique Host Responses, Viral Diversification, and Drug Interactions.
bioRxiv;
2020 May 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-32511352
19.
American Gut: an Open Platform for Citizen Science Microbiome Research.
mSystems;
3(3)2018.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE
| ID: mdl-29795809
20.
A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance
Artigo
em Inglês
| Arca: Repositório institucional da Fiocruz
| ID: arc-51165